数字生命
AI正在加速我们对生命世界的理解,例如通过AI产生新一代人造生命
10/19/2024

今年,人工智能(AI)领域在诺贝尔奖上大放异彩,三次获奖,成为当之无愧的科技明星。这不禁让人遐想,如果将AI的先进算法与生命科学相结合,我们的世界将会发生怎样翻天覆地的变化?

AI在生命科学中的创新潜力

AI的介入可能会极大地加速我们对生命世界的改造。目前,我们所观察到的生命现象,不过是生命历史长河中的一个瞬间切片。尽管我们用各种理论来解释这个世界,但往往陷入一种逻辑陷阱:即某个性状的存在,仅仅是因为它在祖先中存在。例如,我们有五指,是因为我们的祖先有五指,这种解释忽略了其他可能性。然而,AI的出现,为我们提供了一种新的视角和工具,让我们能够探索生命的其他可能性。

现代综合进化论与AI的结合

现代综合进化论认为,大多数变异是中性的,它们很少受到强烈的自然选择影响。这意味着,生物的某些特征并非因为它们提供了生存优势而存在,而可能仅仅是因为它们没有被自然选择所淘汰。AI的加入,可以让我们超越传统的进化理论,通过模拟和预测,探索基因组的潜在变化,例如删除、增加或调整基因编码片段,甚至改变蛋白质的氨基酸组成。这些在实验室中难以实现的大规模实验,对AI来说可能只是小菜一碟。

AI在蛋白质研究中的应用

以蛋白质为例,这是生命的核心物质,也是今年诺贝尔化学奖的焦点。AI在蛋白质研究中的应用已经取得了显著进展。不仅仅是预测已知蛋白质结构的alphafold系列,更是在探索新的蛋白质设计。例如,最新的研究尝试突破20种基本氨基酸的限制,使用RNA核苷酸编码新的氨基酸。此外,AI还被用来设计具有特定功能的新型蛋白质,这在《Science》杂志上发表的两篇论文中得到了体现。

AI不仅在设计新蛋白质方面发挥作用,还能对这些蛋白质进行测试。《Nature Chemical Engineering》上的一篇论文描述了一个自动平台,可以根据蛋白质序列和功能快速测试蛋白质。如果这些研究能够发现全新的、可行的蛋白质结构,那么它们可以直接在实验室中进行尝试,最终创造出全新的蛋白质结构。这对于药物设计等领域具有重大意义,为我们提供了更多的生物治疗策略。

生命改造的前景

当然,如果将AI与生命改造相结合,我们可能会面临一些更为大胆的想法。例如,改造生命本身。2010年,世界上首个人造生命辛西娅(Synthia)的诞生就是一个早期的尝试。通过修改丝状支原体的DNA并移植到山羊支原体中,辛西娅能够自我复制,产生新一代的人造生命。这个生命体中的一段基因是人为编码的,包含了46位科学家的名字和研究所网址,以及一段名言:“生存、犯错、倒下、战胜,用生命创造生命”。

这种生命改造的可能性,让我们不禁思考,如果依靠地球生物的自然进化,要实现这样的生命改造需要多长时间?通过结合AI的预测和蛋白质结构的分析,我们可能能够创造出全新的生命形式,这些生命形式可能是地球自然进化过程中尚未尝试过的。